Північна половина островів лежить в зоні вологого тропічного, а південна - субтропічного клімату. У північній і центральній частинах архіпелагу середня температура липня +27 ° С, січня +30 ° С; на півдні відповідно +25 ... +29 ° С. Сухий сезон припадає на травень-жовтень; вологий - на листопад-квітень. 2-3 циклону проходять через острови зазвичай в грудні-березні. Східні та північно-східні схили гір отримують 4000 мм опадів у рік, південні і західні - до 2300 мм. На великих островах розвинена річкова мережа, є прісноводні озера (ВУИ, Манеро-лаку та ін.)

Схили гір покриті тропічними лісами, прибережні низовини - посівами сільськогосподарських культур. Більша частина лісів (вони займають 35% території) зведена через рубки і частих руйнівних циклонів. Основним видом є баньяновое дерево. У північно-західних і південно-західних долинах, закритих горами, переважає трав'яниста рослинність, на півдні - савани. На островах живуть летючі лисиці і миші, 121 вид птахів (в т. ч. ендеміки «на-мала», відкладають яйця в гниючих рослинах і гарячих солях вулканів), ящірки, змії, гекони, крокодили. У коралових рифах, які оточують острови, водиться 300 видів коралів і 450 видів риб. У країні є 3 природних заповідника: ват і Лору на північному сході о. Еспіріту-Санто і резерват дерев каурі на о. Ероманга.