Клімат субтропічний континентальний, аридний, з жарким і сухим літом. Середня температура на півночі в січні +13 ° С, у серпні +32 ° С (в западині Гхор відзначений максимум 49 ° С), на півдні +20 ° С і +38 ° С відповідно. Перед настанням літа з Аравійської пустелі дме жаркий сухий вітер хамсин. На заході випадає 500-650 мм, на сході - 25-100 мм опадів. Найбільша ріка - Йордан. Часті посухи, повсюдно відчувається брак прісної води.
У ландшафтному відношенні територія країни ділиться на три частини: пустелі, напівпустельні плоскогір'я і долина р.. Йордан. Пустелі займають 88% території (переважно на сході та півдні). У західній частині плоскогір'я - напівпустельна трав'яниста рослинність з переважанням полину, яка висихає влітку. Навесні пустеля і напівпустеля перетворюються на килим квітучих ефемерів. У оазисах (азрак) ростуть фінікові пальми, акації. Долина р.. Йордан родюча, тут є навіть дубові гаї. На схилах навколишніх гір - штучні посадки кедра, оливкових дерев, евкаліптів. На східних схилах долини зростає чорний ірис (національна квітка країни) і живе національна птах - зяблик. У горах на північному заході поширені ліси з алеппськой сосни та ялівцю. Однак усього лісу покривають лише 0,5% території країни; 4,5% площі займають ріллі, 9% - пасовища. Є 6 природних заповідників і один національний парк (Заі).