Клімат екваторіальний, на півдні - субекваторіальний. У горах спостерігається чітко виражена висотна поясність. На великій висоті немає тропічної спеки, а ночі холодні. У міжгірських улоговинах Сьєрри великі коливання нічний і денний температур (наприклад, в Кіто середньорічна денна температура +20 / 22 ° С, нічна 7 ...- 8 ° С). Середньорічна температура на рівнинах складає +23 ... +27 ° С, в Кіто (вис. 2800 м) +13 ° С. Максимальна кількість опадів (до 6000 мм) випадає на східних схилах Анд, 400-1200 мм - в міжгірській западині Сьєрри, мінімальне (100 мм) - на півдні (тут бувають посухи). На вершинах найвищих гір лежать вічні сніги.