Клімат Джібуті відрізняється високими температурами і вкрай малою кількістю опадів. У столиці країни (м. Джібуті), мінімальна річна температура досягає +25 ° С, а максимальна +35 ° С. У червні-серпні в м. Джібуті температура досягає +45 ° С. Опадів на узбережжі випадає ок. 130 мм на рік, а в районі западини Ассаль - не більше 45 мм. Травень і вересень - єдині місяці, коли випадає практично вся річна сума опадів. У цей час відносна вологість повітря досягає 100%, що в поєднанні з дуже високими денними температурами створює майже нестерпні для людини умови - це т. зв. час «тангабілі».

Кліматичні умови не сприяють розвитку багатої рослинності: у країні панують рослинність пустелі і злаково-чагарникові пустельні савани. Лише на звернених до океану схилах хребта Данакіль, що одержують 300-400 мм опадів в рік, зустрічаються ділянки деревовидних ялівців, оливкових дерев, мімоз і акацій. В якості оброблюваних земель може бути використано лише бл. 1% всієї території Джібуті, однак реально обробляється і того менше.