Особливо суворий клімат Альтіплано. Це плоскогір'я, відгороджене високими хребтами від вологих вітрів Тихого океану, за рік отримує здебільшого лише 100-250 мм опадів. Клімат рівнин північного сходу Болівії субекваторіальний - теплий (середня зимова температура +17 ° С, літня +28 ° С) і вологий (1600 мм опадів у рік). На південному сході країни клімат сухий тропічний, опадів випадає менше 800 мм на рік. Головні річки - Бені і Мамору, при злитті утворюють р. Мадейра - найбільша притока Амазонки. Найбільші озера - Тітікака і Поопо. Озеро Тітікака, що лежить на вис. 3812 м - найбільше (8300 кв. Км) з високогірних озер світу. Його глибина досягає 304 м, а температура води постійна (14 ° С). У озеро впадає 45 річок і струмків, а витікає тільки один р. Десагуадеро (від ісп. - Зневоднюються), що з'єднує його з оз. Поопо.

Ліси займають більше 50% території країни і рясніють цінними породами (хінне дерево, чагарник кока). Гірські ліси збереглися в основному в районі оз. Тітікака і в національному парку Сахама. Північний схід Болівії займають вологі екваторіальні лісу (Гілея) - частина амазонськой сельви. На більшій частині Болівійського нагір'я переважають ландшафти гірської злакової степу, у південній посушливій частині Альтіплано - чагарникові пустелі і напівпустелі. На рівнинах Орьенте - різні типи саван. Фауна рівнин Орьенте найбагатша в Болівії: броненосці, мавпи, тапіри, пекарі, пуми, ягуари, Оцелот, мурахоїди і т. д. На луки і пасовища припадає бл. 25% земельного фонду країни, на ріллі - всього 4%. У країні є кілька національних парків (найбільші - Сахама, Ісіборо-Секура, Уанчако, Пілон-Лахас) і заповідник Вулики-Вулики.